Os mangais estão sob ameaça constante de ambos os factores naturais e humanos.

As ameaças naturais aos mangais:
• Alteração climática, resultando numa subida dos níveis do mar e tempestades tropicais mais frequentes
• As inundações ameaçam afogar as árvores de mangal.
• Os caranguejos comem as plântulas de mangal
• As cracas que infestam os mangais podem obstruir o desenvolvimento de novas folhas, rebentos e raízes
• Mudança no caudal de água do Rio Limpopo, o que significa que menos água doce pode chegar aos mangais
• A erosão do solo aumenta a quantidade de sedimento na água, sufocando, por conseguinte, os mangais.
• A erosão do solo aumenta a probabilidade de inundações, que podem afogar os mangais.

As ameaças humanas aos mangais:
• Sobreexploração dos mangais para lenha e material de construção;
• Desmatamento para criar espaço para terras agrícolas
• Os animais domésticos, tal como o gado, pisam ou comem as árvores jovens de mangal